MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp6

Total Repeats: 188

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021228	TTTA	2	8	45	52	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021228	TAAAT	2	10	144	153	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021228	A	6	6	161	166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021228	AT	3	6	187	192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021228	AT	3	6	302	307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021228	TATT	2	8	333	340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021228	T	6	6	356	361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021228	A	6	6	390	395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021228	TAA	3	9	409	417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021228	T	6	6	442	447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021228	ACA	2	6	528	533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021228	T	8	8	596	603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021228	CTG	2	6	608	613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021228	T	7	7	619	625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021228	CAA	2	6	682	687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021228	TTA	2	6	688	693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021228	GAAT	2	8	704	711	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021228	A	7	7	743	749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021228	ATA	2	6	792	797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021228	A	6	6	864	869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021228	A	8	8	884	891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021228	T	6	6	946	951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021228	A	6	6	962	967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021228	AT	4	8	993	1000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021228	TTA	2	6	1016	1021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021228	GCG	2	6	1063	1068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148318
27	NC_021228	AAG	2	6	1091	1096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148318
28	NC_021228	ACC	2	6	1167	1172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148318
29	NC_021228	TCA	3	9	1213	1221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148318
30	NC_021228	TAA	2	6	1273	1278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148318
31	NC_021228	TAA	2	6	1283	1288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148318
32	NC_021228	GTT	2	6	1305	1310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148318
33	NC_021228	CTTCC	2	10	1364	1373	0 %	40 %	0 %	60 %	501148318
34	NC_021228	TTA	2	6	1384	1389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148318
35	NC_021228	T	6	6	1428	1433	0 %	100 %	0 %	0 %	501148318
36	NC_021228	TCT	2	6	1450	1455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148318
37	NC_021228	CAT	2	6	1551	1556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148318
38	NC_021228	AGT	2	6	1581	1586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148318
39	NC_021228	CTTT	2	8	1612	1619	0 %	75 %	0 %	25 %	501148318
40	NC_021228	GAA	2	6	1696	1701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148318
41	NC_021228	GTT	2	6	1733	1738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148318
42	NC_021228	CAG	2	6	1739	1744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148318
43	NC_021228	TCT	2	6	1786	1791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148318
44	NC_021228	TTG	2	6	1794	1799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148318
45	NC_021228	AAAG	2	8	1809	1816	75 %	0 %	25 %	0 %	501148318
46	NC_021228	ATTGA	2	10	1923	1932	40 %	40 %	20 %	0 %	501148318
47	NC_021228	TCCA	2	8	1976	1983	25 %	25 %	0 %	50 %	501148318
48	NC_021228	CAA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148318
49	NC_021228	TAC	2	6	2120	2125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148318
50	NC_021228	ATCAAC	2	12	2145	2156	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	501148318
51	NC_021228	CTTG	2	8	2234	2241	0 %	50 %	25 %	25 %	501148318
52	NC_021228	TTC	2	6	2256	2261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148318
53	NC_021228	GCT	2	6	2407	2412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148318
54	NC_021228	AGC	2	6	2430	2435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148318
55	NC_021228	TAA	2	6	2499	2504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148318
56	NC_021228	CAG	2	6	2525	2530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148318
57	NC_021228	AGG	2	6	2541	2546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501148318
58	NC_021228	AAT	2	6	2652	2657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148318
59	NC_021228	ATA	2	6	2721	2726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148318
60	NC_021228	ACTG	2	8	2758	2765	25 %	25 %	25 %	25 %	501148318
61	NC_021228	TGT	2	6	2857	2862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148318
62	NC_021228	CCA	2	6	2887	2892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148318
63	NC_021228	AAAC	2	8	2900	2907	75 %	0 %	0 %	25 %	501148318
64	NC_021228	CAA	2	6	2919	2924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148318
65	NC_021228	ATA	2	6	2932	2937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148318
66	NC_021228	T	7	7	2979	2985	0 %	100 %	0 %	0 %	501148318
67	NC_021228	CAG	3	9	2996	3004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148318
68	NC_021228	TAG	2	6	3011	3016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148318
69	NC_021228	ATT	2	6	3073	3078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148318
70	NC_021228	AAC	2	6	3081	3086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148318
71	NC_021228	TTA	2	6	3112	3117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148318
72	NC_021228	TTG	2	6	3283	3288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148318
73	NC_021228	CATA	2	8	3321	3328	50 %	25 %	0 %	25 %	501148318
74	NC_021228	TGT	2	6	3343	3348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148318
75	NC_021228	CCT	2	6	3411	3416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_021228	ATT	2	6	3422	3427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021228	AC	3	6	3442	3447	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021228	ATT	2	6	3505	3510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021228	A	6	6	3518	3523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021228	TA	3	6	3557	3562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021228	AATA	2	8	3665	3672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021228	TTG	2	6	3693	3698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148319
83	NC_021228	TTG	2	6	3767	3772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148319
84	NC_021228	TATC	2	8	3824	3831	25 %	50 %	0 %	25 %	501148319
85	NC_021228	ATAA	2	8	3835	3842	75 %	25 %	0 %	0 %	501148319
86	NC_021228	TGT	2	6	4076	4081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148320
87	NC_021228	T	7	7	4098	4104	0 %	100 %	0 %	0 %	501148320
88	NC_021228	TCA	2	6	4110	4115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148320
89	NC_021228	TAC	2	6	4138	4143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148320
90	NC_021228	ATC	2	6	4298	4303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021228	A	6	6	4322	4327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021228	TAA	2	6	4328	4333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021228	CAA	2	6	4376	4381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148321
94	NC_021228	AAG	2	6	4416	4421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148321
95	NC_021228	AAT	2	6	4439	4444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148321
96	NC_021228	CGT	2	6	4457	4462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148321
97	NC_021228	GCTAC	2	10	4490	4499	20 %	20 %	20 %	40 %	501148321
98	NC_021228	A	7	7	4586	4592	100 %	0 %	0 %	0 %	501148321
99	NC_021228	TGT	2	6	4641	4646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148321
100	NC_021228	GCT	2	6	4657	4662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148321
101	NC_021228	TTCC	2	8	4692	4699	0 %	50 %	0 %	50 %	501148321
102	NC_021228	ATTA	2	8	4775	4782	50 %	50 %	0 %	0 %	501148321
103	NC_021228	TTGGT	2	10	4848	4857	0 %	60 %	40 %	0 %	501148321
104	NC_021228	TTA	2	6	4865	4870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148321
105	NC_021228	CAAG	2	8	4916	4923	50 %	0 %	25 %	25 %	501148321
106	NC_021228	T	6	6	4970	4975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021228	GTT	2	6	4977	4982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021228	CTA	2	6	5024	5029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021228	TGG	2	6	5035	5040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021228	TCATT	2	10	5119	5128	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_021228	A	6	6	5144	5149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021228	GTT	2	6	5176	5181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148322
113	NC_021228	T	6	6	5180	5185	0 %	100 %	0 %	0 %	501148322
114	NC_021228	AC	3	6	5202	5207	50 %	0 %	0 %	50 %	501148322
115	NC_021228	AAC	2	6	5208	5213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148322
116	NC_021228	A	7	7	5236	5242	100 %	0 %	0 %	0 %	501148322
117	NC_021228	CAAA	2	8	5266	5273	75 %	0 %	0 %	25 %	501148322
118	NC_021228	TTTC	2	8	5298	5305	0 %	75 %	0 %	25 %	501148322
119	NC_021228	TAAC	2	8	5329	5336	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_021228	TTTAA	2	10	5351	5360	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021228	AAT	2	6	5367	5372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021228	A	8	8	5404	5411	100 %	0 %	0 %	0 %	501148323
123	NC_021228	TGA	2	6	5426	5431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148323
124	NC_021228	TGCT	2	8	5434	5441	0 %	50 %	25 %	25 %	501148323
125	NC_021228	TGA	2	6	5495	5500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148323
126	NC_021228	A	6	6	5545	5550	100 %	0 %	0 %	0 %	501148323
127	NC_021228	AAG	2	6	5554	5559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148323
128	NC_021228	ATT	2	6	5562	5567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148323
129	NC_021228	TTTTG	2	10	5621	5630	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021228	CTG	2	6	5660	5665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021228	TTA	2	6	5711	5716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021228	A	6	6	5869	5874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021228	AACG	2	8	5952	5959	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_021228	GTG	2	6	6056	6061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021228	TA	3	6	6067	6072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021228	ACT	2	6	6258	6263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021228	AATT	2	8	6281	6288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021228	AGG	2	6	6299	6304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021228	GAAAT	2	10	6315	6324	60 %	20 %	20 %	0 %	501148324
140	NC_021228	ATTT	2	8	6387	6394	25 %	75 %	0 %	0 %	501148324
141	NC_021228	T	7	7	6392	6398	0 %	100 %	0 %	0 %	501148324
142	NC_021228	ATT	2	6	6401	6406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148324
143	NC_021228	A	6	6	6528	6533	100 %	0 %	0 %	0 %	501148324
144	NC_021228	T	6	6	6584	6589	0 %	100 %	0 %	0 %	501148324
145	NC_021228	AGA	2	6	6625	6630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148324
146	NC_021228	AGT	2	6	6731	6736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148324
147	NC_021228	AGA	2	6	6802	6807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148324
148	NC_021228	T	6	6	6809	6814	0 %	100 %	0 %	0 %	501148324
149	NC_021228	AGA	2	6	6889	6894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148324
150	NC_021228	A	7	7	6928	6934	100 %	0 %	0 %	0 %	501148324
151	NC_021228	AGAAA	2	10	6988	6997	80 %	0 %	20 %	0 %	501148324
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164	NC_021228	AAAG	2	8	7532	7539	75 %	0 %	25 %	0 %	501148325
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177	NC_021228	A	6	6	7908	7913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_021228	TTA	2	6	8594	8599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_021228	TTAT	2	8	8648	8655	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.